绿巨人在线电影版的剧情从一场基因实验讲起。科学家大卫·班纳试图改造人类基因，却把危险力量留给儿子布鲁斯。布鲁斯从小与父亲分离，忘记童年创伤。多年后，他成为生物科学研究员，只想平静生活。绿巨人在线电影版把这段前史拍得压抑，也为后来的爆发埋下线索。
成年布鲁斯与贝蒂·罗斯相爱，两人在实验室推进研究。一次伽马射线事故中，布鲁斯为救同事暴露在辐射里。此后每当愤怒或心跳失控，他就变成巨大的绿色怪物，也就是绿巨人。军方罗斯将军认定绿巨人是威胁，派兵追捕。贝蒂在恐惧与心疼之间挣扎，成为唯一理解他的人。
绿巨人逃出实验室，在沙漠与坦克、直升机展开激战。他跳得极远，力量惊人，却尽量不伤无辜。布鲁斯醒来后不记得变身经过，只看到满目疮痍。他回到旧居寻找父亲资料，发现大卫·班纳早已把自己当作实验品。绿巨人在线电影版的剧情解说在这里进入核心：真正的怪物并非只有愤怒，还有被野心扭曲的亲情。
大卫·班纳再次出现，他通过吸收电力、金属与生物能量不断强化，变成危险的吸收人。罗斯将军把布鲁斯关押，想提取绿巨人的力量制造武器。贝蒂帮助布鲁斯逃走，两人一路赶往旧金山。布鲁斯逐渐明白，压抑愤怒不能解决问题，只有直面过去，才能控制体内的绿巨人。
高潮发生在城市海湾。大卫吸收大量能量，几乎无人能挡。布鲁斯主动变身绿巨人，与父亲展开毁天灭地的对决。绿巨人不是为了杀戮而战，而是为了阻止父亲继续伤害世界。最终大卫被击败，布鲁斯也付出沉重代价。结局里，布鲁斯隐居南美丛林，继续寻找治愈方法。可当危险来临，他的眼睛再次泛起绿色，绿巨人依旧没有消失。
绿巨人在线电影版剧情解说以开放方式收尾，留下孤独、愤怒与英雄责任。贝蒂和罗斯将军的命运也悬而未决，让在线电影版拥有更复杂的余味。回看绿巨人在线电影版，剧情解说不能只讲打斗。它更像一部关于创伤、亲情和自我接纳的科幻悲剧。绿巨人的力量来自痛苦，也在痛苦中考验人性。在线电影版用缓慢节奏和压抑画面，塑造出不同于普通超级英雄的绿巨人。绿巨人在线电影版剧情解说最终指向一个疑问：当愤怒无法消除，人能否与心中的绿巨人共存。
